Программа для построения 3д моделей молекул органических веществ
Обращаем Ваше внимание, что в соответствии с Федеральным законом N 273-ФЗ «Об образовании в Российской Федерации» в организациях, осуществляющих образовательную деятельность, организовывается обучение и воспитание обучающихся с ОВЗ как совместно с другими обучающимися, так и в отдельных классах или группах.
Рабочие листы и материалы для учителей и воспитателей
Более 2 500 дидактических материалов для школьного и домашнего обучения
- Онлайн
формат - Диплом
гособразца - Помощь в трудоустройстве
Видеолекции для
профессионалов
- Свидетельства для портфолио
- Вечный доступ за 120 рублей
- 311 видеолекции для каждого
МБОУ БГО «Борисоглебская гимназия №1»
Моделирование молекул органических и неорганических соединений
Работу выполнила:
Кучкурда Юлия, обучающаяся 9 «А» класса,
Фомина Екатерина, обучающаяся 7 «А» класса,
МБОУ БГО «Борисоглебская гимназия №1»
Руководитель:
Рязанова Ирина Сергеевна,
МБОУ БГО «Борисоглебская гимназия №1»
Моделирование (лат. modus – мера, образ, способ) издавна применялось в научном познании. Например, возникновение представлений Демокрита и Эпикура об атомах, их форме, и способах соединения, об атомных вихрях и ливнях, объяснения физических свойств различных веществ с помощью представления о круглых и гладких или крючковатых частицах, сцеп ленных между собой. Эти представления являются прообразами современных моделей, отражающих ядерно-электронное строение атома. В науке Нового времени первоначально применялись различные механические модели. Постепенно метод моделирования стал приобретать все большее распространение, проникая во все отрасли научного знания. XX век принес методу моделирования новые успехи, связанные с расцветом кибернетики.
Моделирование на современном этапе приобрело значение общенаучного метода. Его особенностью является то, что для изучения объекта используется опосредующее звено – объект-заместитель. Исходный объект исследования при моделировании называется оригиналом, объект-заместитель – моделью.
По мнению большинства выдающихся химиков, в том числе лауреата нобелевской премии Г. Сиборга, теоретическое моделирование является основным методом познания в химии. Сущность химических явлений скрыта от непосредственного наблюдения исследователя, поэтому познание осуществляют путем построения модели невидимого объекта по косвенным данным.
В данной работе мы смоделируем пространственные модели органических и неорганических соединений и сравним их.
Цель работы заключается в сборе моделей химических веществ органической и неорганической химии, изучении их строения и в создании текстовых и виртуальных проектов.
Для реализации данной цели, мы поставили такие задачи :
собрать материал по заданной теме;
собрать модели молекул;
изучить их строение;
произвести распределение информации по информативным блокам;
произвести эстетическое оформление проекта.
Актуальность данной работы заключается в том, что при изучении химии пространственное воображение играет большую роль и из-за неразвитости этого компонента учащиеся воспринимают тему «Химическая связь» достаточно тяжело, как следствие этого возникают затруднения при изучении классов веществ неорганической и органической химии, химических реакций.
Для сбора информации применялся поисково-аналитический метод, информация бралась из современного источника - интернета ( Yandex , Google ).
Для составления слайдов презентации использовались следующие программы:
для написания текста – Microsoft Office Word 2010;
для демонстрации слайдов— Microsoft Office PowerPoint 2010;
для эстетического восприятия— Microsoft Office PowerPoint 2010.
Модели́рование — исследование объектов познания на их моделях; построение и изучение моделей реально существующих объектов, процессов или явлений с целью получения объяснений этих явлений, а также для предсказания явлений, интересующих исследователя.
В силу многозначности понятия «модель» в науке и технике не существует единой классификации видов моделирования: классификацию можно проводить по характеру моделей, по характеру моделируемых объектов, по сферам приложения моделирования (в технике, физических науках, кибернетике и т. д.).
В настоящее время по технологии моделирования и области применения выделяют такие основные виды моделирования:
By closing this banner and using MolView, you agree with the Terms of Use!
We need your support to create more cool stuff! Donate
Allow MolView to collect annonymous usage data (details)
About
MolView is an intuitive, Open-Source web-application to make science and education more awesome! MolView is mainly intended as web-based data visualization platform. You can use MolView to search through different scientific databases including compound databases, protein databases and spectral databases, and view records from these databases as interactive visualizations using WebGL and HTML5 technologies. This web application is built on top of the JavaScript libraries and online services listed below. The Virtual Model Kit has been a source of inspiration for the birth of this project.
-
JavaScript libraries
- Trash: clear the entire canvas
- Eraser: erase atoms, bonds or the current selection
- Undo/redo: undo or redo your recent changes
- Selection tools: all these tool can be used to drag the current selection or individual atoms and bonds. You can add/remove atoms and bonds to the selection by clicking them. If you have selected a separate fragment, you can rotate it by dragging an atom in the selection. You can delete the selection using the DEL key or using the eraser tool. Each tool has different behavior for the right mouse button:
- Drag: move the entire molecule (you can already use the left mouse button for this)
- Rectangle select: select atoms and bonds using a rectangular selection area
- Lasso select: select atoms and bonds by drawing a freehand selection area
Left toolbar
- Bonds: pick one of the bond types (single, double, triple, up, down) and add or modify bonds
- Fragments: pick one of the fragments (benzene, cyclopropane, etc.) and add fragments
- Chain: create a chain of carbon atoms
- Charge: increment (+) or decrement (-) the charge of atoms
Right toolbar
In this toolbar you can select from a number of elements, you can also pick an element from the periodic table using the last button. You can use the element to create new atoms or modify existing atoms.
You can load molecules from large databases like PubChem and RCSB using the search form located on the left side of the menu-bar. Just type what you are looking for and a list of available molecules will appear.
You can also click on the dropdown button next to the search field to select a specific database. This will perform a more extensive search on the selected database. Currently, three big databases are supported:
- PubChem
- The RCSB Protein Data Bank
- The Crystallography Open Database
The Tools menu contains several utility functions which are listed below.
You can embed a specific compound, macromolecule or crystal using the provided URL or HTML code. Note that the linked structure is the one which is currently displayed in the model window. You can also copy the URL from the address bar in order to link to the current structure.
Export
- Structural formula image: sketcher snapshot (PNG with alpha channel)
- 3D model image: model snapshot (PNG, alpha channel in Glmol and ChemDoodle)
- MOL file: exports a MDL Molfile from the 3D model (common molecules)
- PDB file: exports a Protein Data Bank file from the 3D model (macromolecules)
- CIF file: exports a Crystallographic Information File from the 3D model (crystal structures)
Information card
This collects and displays information about the structural formula.
Spectroscopy
This shows a new layer where you can view molecular spectra of the current structural formula (loaded from the Sketcher) More details are covered in the Spectroscopy chapter.
3D model resource
This redirects you to the web-page for the current 3D model on the website of its source database (except when the model is resolved using the Chemical Identifier Resolver)
Advanced search
These functions allow you to perform some advanced searches through the PubChem database using the structural formula from the sketcher.
- Similarity search: search for compounds with a similar structural formula
- Substructure search: search for compounds with the current structure as subset
- Superstructure search: search for compounds with the current structure as superset
You can open the Spectroscopy view via Tools > Spectroscopy. You can view three kinds of molecular spectra.
- Mass spectrum
- IR spectrum
- H1-NMR prediction
Export data
You can also export different kinds of data from the currently selected spectrum.
- PNG image: snapshot from interactive spectrum
- JCAMP file: JCAMP-DX file of the current spectrum
The Model menu contains some general functions for the 3D model.
Reset
This function sets the model position, zoom and rotation back to default.
Representation
You can choose from a list of different molecule representations including; ball and stick, stick, van der Waals spheres, wireframe and lines. Macromolecules are automatically drawn using ribbons.
Background
You can switch between a black, gray or white background. The default background is black (exported images from GLmol or ChemDoodle have a transparent background)
Engines
You can choose from three different render engines: GLmol, Jmol and ChemDoodle. GLmol is used as default render engine. GLmol and ChemDoodle are based on WebGL, a browser technology to support 3D graphics. If WebGL is not available in your browser, Jmol will be used for all rendering.
MolView automatically switches to:
- Jmol if you execute functions from the Jmol menu
- GLmol if you load macromolecules (due to significant higher performance)
- ChemDoodle if you load a crystal structure (GLmol cannot render crystal structures)
You might want to switch back to GLmol when you do no longer need Jmol or ChemDoodle since GLmol has a better performance.
Note that macromolecules are drawn slightly different in each engine. ChemDoodle provides the finest display. You should, however, avoid using ChemDoodle for very large macromolecules.
Model transformation
You can rotate, pan and zoom the 3D model. Use the right button for rotation, the middle button for translation (except for ChemDoodle) and the scrollwheel for zooming. On touch devices, you can rotate the model with one finger and scale the model using two fingers.
Crystallography
You can load an array of crystal cells (2x2x2 or 1x3x3) or a single unit cell when viewing crystal structures.
Fog and clipping
When you are viewing large structures, like proteins, it can be useful to hide a certain part using fog or a clipping plane. GLmol offers a few options to do this.
- Fog: you can move the fog forward by dragging the mouse up while holding CTRL + SHIFT (drag in the opposite direction to move the fog backward)
- Clipping plane: you can move a frontal clipping plane into the structure by dragging the mouse to the left while holding CTRL + SHIFT (drag in the opposite direction to move the clipping plane back)
The Protein menu offers a number of protein display settings including different color schemes and different chain representations.
Show bio assembly
When loading a protein structure, MolView shows the asymmetric unit by default. This function allows you to view the full biological unit instead.
Chain representation
You can choose from four different chain representations. You can also view the full chain structure by enabling the Bonds option.
- Ribbon: draws ribbon diagram (default representation)
- Cylinder and plate: solid cylinders for α-helices and solid plates for β-sheets
- B-factor tube: tube with B-factor as thickness (thermal motion)
- C-alpha trace: lines between central carbon atom in amino-acids (very fast rendering)
Chain coloring
You can choose from six chain color schemes.
- Secondary structures: different colors for α-helices, β-sheets, etc.
- Spectrum: color spectrum (rainbow)
- Chain: each chains gets a different color
- Residue: all amino-acid residues are colored differently
- Polarity: colors polar amino-acids red and non polar amino-acids white
- B-factor: blue for low B-factor and red for high B-factor (if provided)
The Jmol menu offers some awesome Jmol-only functions and calculations.
Clear
Clears all executed calculations and measurements.
High Quality
Enables High Quality rendering in Jmol (enabled by default on fast devices) When turned off, anti-aliasing is disabled and the model is drawn using lines while transforming it.
Calculations
You can perform the following Jmol calculations in Jmol:
- MEP surface lucent/opaque: calculates and projects molecular electrostatic potential on a translucent or opaque van der Waals surface
- Charge: calculates and projects atomic charge as text label and white to atom color gradient
- Bond dipoles: calculates and draws individual bond dipoles
- Overall dipole: calculates and draws net bond dipole
- Energy minimization: executes an interactive MMFF94 energy minimization (note that this function only executes a maximum of 100 minimization steps at a time)
Measurement
You can measure distance, angle and torsion using Jmol. You can activate and deactivate one of these measurement types via the Jmol menu.
- Distance distance between two atoms in nm
- Angle angle between two bonds in degrees
- Torsion torsion between four atoms in degrees
Note that in some cases, the resolved 3D model is only an approach of the real molecule, this means you have to execute an Energy minimization in order to do reliable measurements.
Embed
Width
Height
HTML code
You can use the HTML code below to embed the current 3D model in your website.
Программа для создания 3D-моделей молекул. В этой программе легко построить структуру любого органического соединения, поскольку она содержит множество инструментов: функциональные группы, аминокислоты, нуклеиновые кислоты, углеводы и др. Каждый структурный фрагмент можно добавить на экран или присоединить к любому атому. Щелчок по кнопке "H" автоматически добавит все атомы водорода. С помощью инструмента "Эскиз" легко построить любую структуру произвольного строения. Программа имеет множество полезных функций и особенностей. ChemSite 3.01 + русификатор (*.zip) - 2,5 Мб
Таблица Менделеева для Андроида V1.5.1
- формат zip
- размер 1.06 МБ
- добавлен 29 июня 2011 г.
Изучайте таблицу Менделеева вместе с Сократикой. Более 30 фактов о каждом элементе. Аудиоклипы с названиями элементов. Проверьте свои знания, пройдя тест. Быстрый доступ к нужному элементу через таблицу, поиск или индекс. Русский интерфейс: Да Системные требования (Android OS all). Лицензия (freeware). Автор неизвестен.rn
ACD ChemSketch 10 (Freeware version)
- формат exe
- размер 24.37 МБ
- добавлен 13 мая 2011 г.
Удобный химический редактор для написания статей, рефератов, оформления курсовых и дипломных работ; компания Advanced Chemical Development (ACD/Labs) предоставляет его в бесплатное пользование для образовательных целей. ChemSketch - редактор химических структур с возможностью работы с Internet-базами химических соединений ( PubChem и eMolecules), расчёта основных параметров соединения, построения и просмотра 3D-изображений молекул. Для начала.
Avogadro 1.0.1 (FreeWare) - 3D визуализация
- формат exe
- размер 8.21 МБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
Avogadro - расширенный молекулярный редактор, разработанный для использования на нескольких платформах (в частности на ОС Windows), по вычислительной химии, молекулярному моделированию, биоинформатике, науке о материалах и др.rn
ChemCraft v.1.6 (ShareWare) - 3D визуализация молекул
- формат exe
- размер 2.37 МБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
ChemCraft - квантово-химический визуализатор, который понимает множество форматов химических данных, выводы большинства популярных программ (таких, в частности, как GAMESS и Gaussian); имеет прекрасный "дружественный" интерфейс, большое количество отображаемых свойств, начиная от длин связей и до рендеринга молекулярных орбиталей и нормальных колебаний. Множество стилей отображения молекул позволяют получить изображения нужного качества. ChemCraf.
ChemPen3D 1.9.0.9 (ShareWare) - 3D визуализация молекул
- формат rar
- размер 1.57 МБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
Программа, предназначенная для создания 3D-моделей молекул. Содержит встроенный модуль квантово-химической минимизации энергии системы. Нарисованную модель можно вращать, сообщить ей колебательные движения. Можно нарисовать обычную двухмерную структурную формулу, после чего посмотреть ее в трехмерном виде, сохранить в различных форматах (в т. ч. JPEG, BMP). ChemPen3D 1.9.0.9 - (*.zip) - 1,47 Мб. Русификатор ChemPen3D 1.9.0.9 (101 Кб)rn
Orbital Viewer 1.04 (FreeWare) - 3D визуализация орбиталей атомов и молекул
- формат exe
- размер 553.24 КБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
Orbital Viewer - программа, созданная специально для визуализации орбиталей. Строит s, p, d, f - орбитали для одного или нескольких атомов. Файлы могут быть сохранены как в собственном формате, так и в форматах TIFF, PPM, BMP, AVI и формате VRML. Программа распространяется бесплатно. Обратите внимание: если после русификации Панель инструментов не отображается, зайдите в меню Файл / Настроить панель инструментов и нажмите на кнопку Сброс - програ.
RasMol 2.7.5 (FreeWare) - 3D визуализация молекул
- формат exe
- размер 862.32 КБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
Компьютерная программа, предназначенная для визуализации молекул и используемая преимущественно для изучения и получения изображений пространственных структур биологических макромолекул, в первую очередь белков и нуклеиновых кислот. RasMol продолжают активно использовать молекулярные биологи и биоинформатики. Благодаря простой и логичной структуре пользовательского интерфейса, программа проста для освоения. Система команд (язык RasMol'а) использу.
WinMOPAC 7.21
- формат docx, exe, jpg
- размер 1.05 МБ
- добавлен 25 мая 2011 г.
XtalDraw 1.0 (FreeWare) - 3D визуализация молекул и кристаллических структур
- формат exe
- размер 1.77 МБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
XtalDraw - программа для визуализации кристаллических и молекулярных структур в виде шаростержневых моделей, многогранников и объемных моделей. Программа содержит большой набор файлов данных, поддерживает не только файлы данных XtalDraw, но и американские минералогические базы данных (American Mineralogist Crystal Structure Database). XtalDraw с большой достоверностью показывает, что большинство неорганических веществ имеет немолекулярное строени.
Zem 0.3 Beta - редактор молекул
- формат txt, exe
- размер 27.4 МБ
- добавлен 02 апреля 2011 г.
Zem - полезный редактор для рисования структурных формул молекул. Zem читает и пишет более чем в 80 химических форматах и таких графических форматах, как: bmp.jpg.svg и.jpg.rn
Avogadro - расширенный молекулярный редактор, разработанный для использования на нескольких платформах (в частности на ОС Windows), по вычислительной химии, молекулярному моделированию, биоинформатике, науке о материалах и др.
Таблица Менделеева для Андроида V1.5.1
- формат zip
- размер 1.06 МБ
- добавлен 29 июня 2011 г.
Изучайте таблицу Менделеева вместе с Сократикой. Более 30 фактов о каждом элементе. Аудиоклипы с названиями элементов. Проверьте свои знания, пройдя тест. Быстрый доступ к нужному элементу через таблицу, поиск или индекс. Русский интерфейс: Да Системные требования (Android OS all). Лицензия (freeware). Автор неизвестен.rn
ACD ChemSketch 10 (Freeware version)
- формат exe
- размер 24.37 МБ
- добавлен 13 мая 2011 г.
Удобный химический редактор для написания статей, рефератов, оформления курсовых и дипломных работ; компания Advanced Chemical Development (ACD/Labs) предоставляет его в бесплатное пользование для образовательных целей. ChemSketch - редактор химических структур с возможностью работы с Internet-базами химических соединений ( PubChem и eMolecules), расчёта основных параметров соединения, построения и просмотра 3D-изображений молекул. Для начала.
ChemCraft v.1.6 (ShareWare) - 3D визуализация молекул
- формат exe
- размер 2.37 МБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
ChemCraft - квантово-химический визуализатор, который понимает множество форматов химических данных, выводы большинства популярных программ (таких, в частности, как GAMESS и Gaussian); имеет прекрасный "дружественный" интерфейс, большое количество отображаемых свойств, начиная от длин связей и до рендеринга молекулярных орбиталей и нормальных колебаний. Множество стилей отображения молекул позволяют получить изображения нужного качества. ChemCraf.
ChemPen3D 1.9.0.9 (ShareWare) - 3D визуализация молекул
- формат rar
- размер 1.57 МБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
Программа, предназначенная для создания 3D-моделей молекул. Содержит встроенный модуль квантово-химической минимизации энергии системы. Нарисованную модель можно вращать, сообщить ей колебательные движения. Можно нарисовать обычную двухмерную структурную формулу, после чего посмотреть ее в трехмерном виде, сохранить в различных форматах (в т. ч. JPEG, BMP). ChemPen3D 1.9.0.9 - (*.zip) - 1,47 Мб. Русификатор ChemPen3D 1.9.0.9 (101 Кб)rn
ChemSite 3.01 (FreeWare) - 3D визуализация молекул
- формат txt, exe
- размер 2.5 МБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
Программа для создания 3D-моделей молекул. В этой программе легко построить структуру любого органического соединения, поскольку она содержит множество инструментов: функциональные группы, аминокислоты, нуклеиновые кислоты, углеводы и др. Каждый структурный фрагмент можно добавить на экран или присоединить к любому атому. Щелчок по кнопке "H" автоматически добавит все атомы водорода. С помощью инструмента "Эскиз" легко построить любую структуру п.
Orbital Viewer 1.04 (FreeWare) - 3D визуализация орбиталей атомов и молекул
- формат exe
- размер 553.24 КБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
Orbital Viewer - программа, созданная специально для визуализации орбиталей. Строит s, p, d, f - орбитали для одного или нескольких атомов. Файлы могут быть сохранены как в собственном формате, так и в форматах TIFF, PPM, BMP, AVI и формате VRML. Программа распространяется бесплатно. Обратите внимание: если после русификации Панель инструментов не отображается, зайдите в меню Файл / Настроить панель инструментов и нажмите на кнопку Сброс - програ.
RasMol 2.7.5 (FreeWare) - 3D визуализация молекул
- формат exe
- размер 862.32 КБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
Компьютерная программа, предназначенная для визуализации молекул и используемая преимущественно для изучения и получения изображений пространственных структур биологических макромолекул, в первую очередь белков и нуклеиновых кислот. RasMol продолжают активно использовать молекулярные биологи и биоинформатики. Благодаря простой и логичной структуре пользовательского интерфейса, программа проста для освоения. Система команд (язык RasMol'а) использу.
XtalDraw 1.0 (FreeWare) - 3D визуализация молекул и кристаллических структур
- формат exe
- размер 1.77 МБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
XtalDraw - программа для визуализации кристаллических и молекулярных структур в виде шаростержневых моделей, многогранников и объемных моделей. Программа содержит большой набор файлов данных, поддерживает не только файлы данных XtalDraw, но и американские минералогические базы данных (American Mineralogist Crystal Structure Database). XtalDraw с большой достоверностью показывает, что большинство неорганических веществ имеет немолекулярное строени.
Orbital Viewer - программа, созданная специально для визуализации орбиталей. Строит s, p, d, f - орбитали для одного или нескольких атомов. Файлы могут быть сохранены как в собственном формате, так и в форматах TIFF, PPM, BMP, AVI и формате VRML. Программа распространяется бесплатно. Обратите внимание: если после русификации Панель инструментов не отображается, зайдите в меню Файл / Настроить панель инструментов и нажмите на кнопку Сброс - программа будет готова к работе. Orbital Viewer 1.04 (*.exe) - 586 Кб. Русификатор Orbital Viewer 1.04 (39,4 Кб)
Таблица Менделеева для Андроида V1.5.1
- формат zip
- размер 1.06 МБ
- добавлен 29 июня 2011 г.
Изучайте таблицу Менделеева вместе с Сократикой. Более 30 фактов о каждом элементе. Аудиоклипы с названиями элементов. Проверьте свои знания, пройдя тест. Быстрый доступ к нужному элементу через таблицу, поиск или индекс. Русский интерфейс: Да Системные требования (Android OS all). Лицензия (freeware). Автор неизвестен.rn
ACD ChemSketch 10 (Freeware version)
- формат exe
- размер 24.37 МБ
- добавлен 13 мая 2011 г.
Удобный химический редактор для написания статей, рефератов, оформления курсовых и дипломных работ; компания Advanced Chemical Development (ACD/Labs) предоставляет его в бесплатное пользование для образовательных целей. ChemSketch - редактор химических структур с возможностью работы с Internet-базами химических соединений ( PubChem и eMolecules), расчёта основных параметров соединения, построения и просмотра 3D-изображений молекул. Для начала.
Avogadro 1.0.1 (FreeWare) - 3D визуализация
- формат exe
- размер 8.21 МБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
Avogadro - расширенный молекулярный редактор, разработанный для использования на нескольких платформах (в частности на ОС Windows), по вычислительной химии, молекулярному моделированию, биоинформатике, науке о материалах и др.rn
ChemCraft v.1.6 (ShareWare) - 3D визуализация молекул
- формат exe
- размер 2.37 МБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
ChemCraft - квантово-химический визуализатор, который понимает множество форматов химических данных, выводы большинства популярных программ (таких, в частности, как GAMESS и Gaussian); имеет прекрасный "дружественный" интерфейс, большое количество отображаемых свойств, начиная от длин связей и до рендеринга молекулярных орбиталей и нормальных колебаний. Множество стилей отображения молекул позволяют получить изображения нужного качества. ChemCraf.
ChemPen3D 1.9.0.9 (ShareWare) - 3D визуализация молекул
- формат rar
- размер 1.57 МБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
Программа, предназначенная для создания 3D-моделей молекул. Содержит встроенный модуль квантово-химической минимизации энергии системы. Нарисованную модель можно вращать, сообщить ей колебательные движения. Можно нарисовать обычную двухмерную структурную формулу, после чего посмотреть ее в трехмерном виде, сохранить в различных форматах (в т. ч. JPEG, BMP). ChemPen3D 1.9.0.9 - (*.zip) - 1,47 Мб. Русификатор ChemPen3D 1.9.0.9 (101 Кб)rn
ChemSite 3.01 (FreeWare) - 3D визуализация молекул
- формат txt, exe
- размер 2.5 МБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
Программа для создания 3D-моделей молекул. В этой программе легко построить структуру любого органического соединения, поскольку она содержит множество инструментов: функциональные группы, аминокислоты, нуклеиновые кислоты, углеводы и др. Каждый структурный фрагмент можно добавить на экран или присоединить к любому атому. Щелчок по кнопке "H" автоматически добавит все атомы водорода. С помощью инструмента "Эскиз" легко построить любую структуру п.
RasMol 2.7.5 (FreeWare) - 3D визуализация молекул
- формат exe
- размер 862.32 КБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
Компьютерная программа, предназначенная для визуализации молекул и используемая преимущественно для изучения и получения изображений пространственных структур биологических макромолекул, в первую очередь белков и нуклеиновых кислот. RasMol продолжают активно использовать молекулярные биологи и биоинформатики. Благодаря простой и логичной структуре пользовательского интерфейса, программа проста для освоения. Система команд (язык RasMol'а) использу.
WinMOPAC 7.21
- формат docx, exe, jpg
- размер 1.05 МБ
- добавлен 25 мая 2011 г.
XtalDraw 1.0 (FreeWare) - 3D визуализация молекул и кристаллических структур
- формат exe
- размер 1.77 МБ
- добавлен 13 октября 2010 г.
XtalDraw - программа для визуализации кристаллических и молекулярных структур в виде шаростержневых моделей, многогранников и объемных моделей. Программа содержит большой набор файлов данных, поддерживает не только файлы данных XtalDraw, но и американские минералогические базы данных (American Mineralogist Crystal Structure Database). XtalDraw с большой достоверностью показывает, что большинство неорганических веществ имеет немолекулярное строени.
Zem 0.3 Beta - редактор молекул
- формат txt, exe
- размер 27.4 МБ
- добавлен 02 апреля 2011 г.
Zem - полезный редактор для рисования структурных формул молекул. Zem читает и пишет более чем в 80 химических форматах и таких графических форматах, как: bmp.jpg.svg и.jpg.rn
Читайте также:
-
: Chemical 2D data reader/writer : primary 3D render engine : 3D render engine : 3D render engine and spectrum display
Click one of the subjects below to learn more. You can also watch some videos on YouTube to get started.
Subjects
MolView consists of two main parts, a structural formula editor and a 3D model viewer. The structural formula editor is surround by three toolbars which contain the tools you can use in the editor. Once you’ve drawn a molecule, you can click the 2D to 3D button to convert the molecule into a 3D model which is then displayed in the viewer. Below is a list of all sketch tools.