Whonet международная компьютерная программа для мониторинга антибиотикорезистентности
WHONET – это бесплатное настольное приложение Windows для управления и анализа данных микробиологических лабораторий с особым упором на наблюдение за устойчивостью к АМП. Программа разработана и поддержана Сотрудничающим центром ВОЗ по надзору за устойчивостью к АМП [68] .
Помимо встроенных справочников материалов, организмов и антибиотиков, программа имеет уже настроенные критерии интерпретации чувствительности EUCAST и CLSI (M100, M45, M60, M61, доступ к беcплатным ресурсам, в том числе ветеринарным VET03, VET04, VET06 и VET08), настроенные панели тестирования для каждого вида микроорганизмов и встроенную экспертную систему.
WHONET также включает модуль импорта данных под названием BacLink для сбора и стандартизации данных из существующих настольных приложений, лабораторных приборов и лабораторных информационных систем [69] . Подробнее о работе с данным модулем можно прочитать на официальном сайте программы, а также в разделе, посвященном работе с BacLink.
Механизмы построения отчетов предоставляют широкие возможности для анализа данных чувствительности. Данное руководство не ставит себе целью описывать все возможности программы WHONET, для этого лучше обратиться к официальной документации программы [70] , либо воспользоваться справкой в самой программе.
6.3.1 Создание новой лаборатории
Для начала работы с WHONET необходимо создать и сконфигурировать новую лабораторию [71] . При первом запуске программы предлагается выбрать лабораторию с демонстрационными данными.
Чтобы создать новую лабораторию, в стартовом окне программы необходимо нажать кнопку Новая лаборатория, в открывшемся окне выбрать страну Российская Федерация, ввести произвольное название лаборатории и указать её код. Код следует указывать латинскими символами, так как он будет использоваться в качестве расширения по умолчанию для всех файлов, связанных с созданной лабораторией. В дальнейшем при создании новых лабораторий можно копировать конфигурации лабораторий с помощью кнопки Скопировать лабораторию.
После этого необходимо пройти дополнительные шаги настройки, связанные с непосредственной деятельностью лаборатории, поэтому требуется заранее собрать информацию о АМП и методах тестирования, используемых в лаборатории, а также о стационарах, с которыми взаимодействует лаборатория и откуда поступают образцы.
6.3.1.1 Настройка антибиотиков (обязательно)
Для открытия окна настройки антибиотиков, методов и контрольных точек нужно нажать кнопку Антибиотики. Появится окно со списком антибиотиков, доступных в WHONET, (слева) и списков антибиотиков для работы в лаборатории.
Порядок добавления антибиотиков в лабораторию следующий:
- Выбрать надлежащие рекомендации (рекомендуется EUCAST).
- Кликнуть на нужный метод тестирования (DDM, MIC, Е-тест).
- Выбрать подходящий антибиотик (и нагрузку диска, если речь идет о диско-диффузионном методе).
Чтобы выбрать антибиотик, нужно дважды кликнуть по нему или же кликнуть по нему один раз, а затем нажать на кнопку со стрелкой вправо –>. Для удаления выбранного антибиотика нужно нажать кнопку со стрелкой влево
Каждому антибиотику присваивается код (до девяти знаков), который включает в себя:
- трехбуквенный код антибиотика;
- однобуквенный код, отсылающий к типу используемых критериев интерпретации (например, E=EUCAST);
- однобуквенный код, обозначающий метод тестирования (D=DDM, M=MIC, E=ETest);
- нагрузка диска (при тестировании диско-диффузионным методом).
В отношении МПК или ETest необходимо выбрать только нужный антибиотик и соответствующие критерии интерпретации. Например, код ATM_ED30 расшифровывается следующим образом: азтреонам, EUCAST, DDM, 30 μg, тогда как ATM_EM означает: азтреонам, EUCAST, MIC.
Дальнейшие настройки антиботиков необязательны, но тем не менее могут быть полезны.
6.3.1.2 Пограничные значения для антибиотиков (Breakpoints) (необязательно)
При вводе данных чувствительности программа автоматически интерпретирует их, исходя из установленных пограничных значений. В большинстве случаев их менять не требуется, но для особых случаев предусмотрена такая возможность. Чтобы открыть окно редактирования пограничных значений, требуется нажать кнопку Breakpoints.
Доступны следующие опции:
- Общие – используются для установки пограничных значений для всех видов.
- Видоспецифические – используются для установки пограничных значений для конкретных видов, по приоритету стоят выше общих (для EUCAST заполняются только видоспецифические пограничных значения). Все изменения необходимо осуществлять именно здесь.
Квалифицированные правила интерпретации служат для создания экспертных правил интерпретации.
При введении пограничных значений МПК для комбинированных препаратов, таких как триметоприм/сульфаметоксазол, необходимо указывать концентрацию первого компонента. Эти концентрации обычно соответствуют сериям двойного разведения 1, 2, 4 мг/л.
6.3.1.3 Наборы антибиотиков (Панели) (необязательно)
В целях упрощения ввода данных присутствует возможность настроить панели тестируемых антибиотиков для каждой группы микроорганизмов с помощью кнопки Наборы. В открывшемся окне можно указать, какие антибиотики тестируются по каждому виду микроорганизмов. Однако в момент ввода данных допускается добавление результатов для антибиотиков, не предусмотренных в панели.
6.3.1.4 Отделение
Данная опция является необязательной с точки зрения работы программы WHONET, но обязательна в рамках организации мониторинга АР.
В рамках данного справочника можно завести несколько отделений из разных учреждений. При этом используется трехуровневая иерархическая структура: Учреждение – Отделение – Тип отделения. Справочники учреждений и отделений при этом могут быть отредактированы самим пользователем.
6.3.1.5 Поля данных
Программа WHONET автоматически определяет набор стандартных полей данных. К стандартным полям относится такая информация, как уникальный идентификатор пациента, местонахождение, дата получения образца, тип образца, микроорганизм/возбудитель, панель антибиотиков.
Для организации полноценного мониторинга АР может потребоваться внесение дополнительных полей, таких как диагноз пациента, локализация инфекции, другие значимые данные. Чтобы добавить такие поля, требуется нажать кнопку Поля данных в окне настройки лаборатории. Откроется окно Поля данных, в нем необходимо нажать кнопку Изменить список.
Слева находятся списки категорий данных WHONET (клинические данные, инфекционный контроль и т.п.) и полей данных (диагноз, дата поступления пациента и т.п.), из которых пользователь может выбирать нужные ему категории и поля. Справа – поля, которые доступны в конфигурации текущей лаборатории. Поля добавляются двойным нажатием либо кнопкой –>.
Для того, чтобы добавить поле, которое отсутствует в списке, нужно дважды кликнуть по пункту (Определенный для пользователя…) и в появившемся окне указать название, тип и описание нового поля.
Для полей можно определить справочники, которые будут использоваться для заполнения. Это позволит снизить количество ошибок, а также увеличит скорость ввода за счет кодов. Чтобы определить такие справочники, необходимо выбрать поле и нажать кнопку Код список.
На этом настройку лаборатории можно считать завершенной. После сохранения конфигурации можно приступать к вводу данных. Остальные разделы настройки являются более специфичными и не относятся к теме данного руководства. Работа с ними подробно описана в официальной документации к программе.
6.3.2 Ввод данных
Для организации хранения и формирования интерфейса для ввода информации WHONET использует структуру данных, определенную текущими настройками лаборатории. Структура данных – это своего рода инструкции, как должен быть устроен файл с данными. На основании структуры данных для лаборатории можно создать один или несколько файлов с данными. Это может быть полезно в случаях, когда одной конфигурацией пользуется несколько лабораторий одновременно, либо одна лаборатория хранит данные за разные периоды в разных файлах на диске.
Чтобы начать ввод, необходимо создать новый или выбрать существующий файл данных.
Откроется окно ввода данных.
Данные необходимо вводить в поля, расположенные в левой половине экрана. Когда курсор переключается на то или иное поле для ввода данных, в правом нижнем углу экрана появляются краткие инструкции и рекомендуемые коды данных для этого поля. Переходить по полям можно с помощью кнопок Enter, Tab, стрелками. После ввода даты и перехода к следующему полю пользователю следует убедиться в том, что дата была прочитана верно: WHONET автоматически преобразует числовое обозначение месяца в название месяца. При введении даты год может быть введен как в виде двузначной, так и в виде четырехзначной цифры. Числа, обозначающие день, месяц и год, должны быть разделены косой чертой /, дефисом или пробелом.
После того как будут введены все данные об изоляте, нужно нажать кнопку Сохранить изолят (или комбинация клавиш Alt+С). WHONET предложит три варианта сохранения записи:
- сохранить изолят,
- сохранить и продолжить работу с тем же изолятом,
- сохранить и продолжить работу с тем же пациентом.
Выбор одной из этих опций сохраняет информацию и очищает экран Ввод данных для ввода данных следующего изолята (полностью или частично).
6.3.3 Просмотр данных
При открытии файла данных всегда по умолчанию открывается форма для ввода нового образца. Чтобы посмотреть информацию по всем образцам в файле, нужно нажать на этой форме кнопку Просмотреть базу данных.
По данной таблице можно осуществлять поиск, удаление записей, вывод результатов на печать и даже осуществлять быстрое редактирование для некоторых полей. Чтобы перейти к полноценной форме редактирования, требуется выделить интересующую строку и нажать кнопку Редактировать.
6.3.4 Объединение данных
К преимуществам WHONET можно отнести концепцию разделения конфигурации лаборатории и ее файла данных. Благодаря этому на основе одной конфигурации можно создавать несколько файлов данных с одинаковой структурой и «протоколом» хранения для разных лабораторий, а затем объединять и агрегировать эти данные. На этом принципе построена работа в таких междунароных системах эпиднадзора за устойчивостью к АМП, как GLASS и CAESAR.
Порядок действий для объединения файлов WHONET, полученных от разных центров/лабораторий/стационаров:
- Выбрать лабораторию с требуемой конфигурацией, нажать кнопку Открыть лабораторию.
- В меню Ввод данных выбрать пункт Объединять, экспортировать или шифровать файлы данных.
- В появившемся окне выбрать файлы, которые требуется объединить с помощью кнопки Файлы данных, указать, куда сохранить объединенный файл данных. Если данный файл предполагается передавать в сторонние центральные лаборатории или другие организации, необходимо отметить галочку Зашифровать информацию о пациентах. В этом случае персональные данные в объединенном файле будут удалены. Для начала процесса объединения необходимо нажать кнопку Совместить.
6.3.5 Экспорт данных
Одно из главных преимуществ WHONET состоит в возможности обмениваться стандартизированными данными с другими лабораториями, например, в национальной сети эпиднадзора.
Однако текущая версия WHONET не имеет достаточно гибких возможностей для углубленного анализа и представления данных, а также существенно ограничена при использовании мультидисциплинарной командой с целью мониторинга АР. Получаемые отчеты лишены интерактивности и удобных возможностей быстрого переключения параметров и сравнения полученных результатов. Для этого гораздо удобнее использовать AMRcloud. Существует возможность подготовить данные, хранящиеся в датафайлах программы WHONET, к загрузке в AMRcloud.
Nearly all of these documents are included with WHONET.
You may find them on your computer by clicking Help -->Documentation
WHONET 5.6 & WHONET 2021
WHONET for GLASS
WHONET for GLASS - English
WHONET for GLASS - Arabic
WHONET for GLASS - Chinese
WHONET for GLASS - French
WHONET for GLASS - Russian
WHONET for GLASS - Spanish
WHONET for GLASS - Urdu
WHONET for EARS-Net and CAESAR
WHONET Antimicrobial codes
WHONET videos
Data entry webinar
Videos - Please note that the first video has poor audio quality, but this was resolved in subsequent sessions.
Presentation summaries
WHONET-Doctors Without Borders (MSF) Training
BacLink
Additional resources
United Arab Emirates antibiograms
WHONET-AGISAR | Spanish language documents
1- Manuales Integrados Instalación y Carga de datos WHONET
Este documento contiene el paso a paso desde la instalación de WHONET hasta la configuración de un laboratorio WHONET argentina. Como te había adelantado en la página 11 de este manual, esta la configuración estandarizada de las salas. Este documento es el primer documento que tendrían que tener los participantes.
2- Instructivo para agregado de drogas nuevas CPT para Red WHONET
Este documento es un ejemplo para agregar drogas nuevas a las ya elegidas, también permite la modificación y/o agregado de puntos de corte
3- Protocolo WHONET consensuado 2017 final
Es nuestro protocolo de trabajo actual, básicamente que paneles de ATBs se usan para cada microorganismo.
4- Check list Protocolo WHONET 2016
Parecido al anterior, pero sire para asegurarse de tener la configuración actualizada en la planilla de ingreso.
5-Instructivo para la modificación y creación de nuevos campos 2017
Un poco lo que vimos en el taller, en este documento se muestra como crear los nuevos campos de mecanismos de resistencia. En nuestro caso no estábamos quedando sin campos disponibles, es por eso que optamos por crear campos que permitan un desplegable con nuevos mecanismos.
6- Listado de Campos WHONET 2015
Un check list de los desplegables WHONET Argentina, para los campos, diagnostico, enfermedad de base y factor de riesgo
7- Manual WHONET español comprimido
Esta es una traducción al “Argentino” del manual original de WHONET en ingles
WHO Collaborating Centre for Surveillance of Antimicrobial Resistance
WHONET
Supporting Global Surveillance of Infectious Diseases
WHONET
Automated Outbreak Detection Software, Services, and Full Support
The microbiology laboratory database software.
WHONET is a free desktop Windows application for the management and analysis of microbiology laboratory data with a particular focus on antimicrobial resistance surveillance developed and supported by the WHO Collaborating Centre for Surveillance of Antimicrobial Resistance at the Brigham and Women's Hospital in Boston, Massachusetts. WHONET, available in 44 languages, supports local, national, regional, and global surveillance efforts in over 2,300 hospital, public health, animal health, and food laboratories in over 130 countries worldwide.
Features include:
- Laboratory configuration
- Data entry and clinical reporting
- Data analysis and report generation
- Data exports to surveillance networks including WHO GLASS, EARS-Net, CAESAR, ReLAVRA, and JANIS
- Support for CLSI human (M100, M45, M60, M61, access free resources) and veterinary (VET01, VET03, VET04, and VET06) antimicrobial susceptibility test breakpoints
- Support for EUCAST human antimicrobial susceptibility test breakpoints. EUCAST veterinary breakpoints are in development.
- New option for saving WHONET data as SQLite files
WHONET also includes a data import module called BacLink for the capture and standardization of data from existing desktop applications, laboratory instruments, and laboratory information systems.
Download
We offer both 32-bit and 64-bit versions of WHONET. Either version should work well for most users. For best compatibility with Microsoft Excel and Access, we recommend using the version of WHONET which matches your version of Microsoft Office. You can find out which version of Office you have by clicking here.
Build date: 2022-05-10
Version: 22.5.10
WHONET Data platform
We are excited to announce that WHONET offers a new data structure option called SQLite, which offers many advantages over the simple dBASE structure that WHONET has used for many years including:
- Improved performance and faster analyses
- More sophisticated data file management
- Additional security features
WHONET-SaTScan | Daily, Weekly, Monthly, Annual Reports
Cluster Alerts
For many years, WHONET has had the ability to present temporal trends in organism frequencies and resistance proportions in the form of descriptive statistics and graphs. The user could then examine these trends and graphs individually in efforts to detect and characterize possible community or hospital outbreaks of microorganisms. WHONET was not able to highlight potential clusters in an automatic fashion in order to focus the attention of the software user on possible outbreaks or to provide statistical guidance as to whether observed trends were statistically significant.
To facilitate the early and broad detection of possible outbreaks, we have integrated a powerful freeware tool developed for purposes of cluster detection in public health data.
SaTScan™, a trademark of Martin Kulldorf, was developed under the joint auspices of Martin Kulldorf, of the National Cancer Institute and of Farzad Mostarashi at the New York City Department of Health and Mental Hygiene. Dr. Kulldorf is an Associate Professor and Biostatistician at Harvard Medical School and Harvard Pilgrim Health Care, Department of Ambulatory Care and Prevention, Boston, USA.
Isolate listings
Another useful feature of WHONET is the creation of lists of isolates or patients that meet certain criteria – for example a lists of patients with MRSA or positive blood cultures from the neonatal intensive care unit. WHONET can create such lists as well as summarize the results in a number of different ways.
Click on “Analysis type”, and select “Isolate listing and summary”. For the summary, by default WHONET will use the variable “Organism” for the rows and “Specimen date” by month for the columns.
For this tutorial, make one small change to the options. Next to specimen date appears the option “Month”. Because there is only one month of data to analyze in this tutorial, it will be more interesting to show the results by day or by week. Select the option “Day”. Leave the other options unchanged, and click “OK”. Click on “Begin analysis”. In this example, WHONET will show you a list of all isolates from the data set with Enterobacteriaceae, as below.
You can read more about WHONET in our FAQ section.
%RIS Statistics
%RIS and test measurement statistics for Staph. aureus, E. coli, K. pneumoniae, and more. %Resistant results are shown to the left for all antimicrobials, including the 95% confidence interval. The graph to the right depicts the distribution of disk diffusion zone diameters around the gentamicin disk.
You can read more about WHONET in our FAQ section.
Scatterplot
Scatterplot comparison of gentamicin and amikacin results for K. pneumoniae. To the left is a comparison of the disk diffusion zone diameter results. To the right is the comparison using the test interpretations – resistance, intermediate, and susceptible.
Custom macros
The software permits a number of algorithms for the detection of event clusters. Options include retrospective or prospective cluster detection; purely temporal, pure spatial, or space-time clusters; and flexible parameter selection for space and time variables.
In this first version of an integrated WHONET-SaTScan package, WHONET is using a space-time permutation probability model, using Monte Carlo simulations. In collaboration with Dr. Kulldorf in a five-year NIH project entitled “Modeling Infectious Disease Agent Study” (MIDAS), we will test out a number of additional algorithms, models, and parameters, and these optimized routines will eventually be offered through the WHONET user interface.
Automation
Cluster detection for the Infection Preventionist or Quality Departments! Automated daily data extractions from your system into WHONET. WHONET-SaTScan uses the space and time poisson modal to statistically detect potential cluster signals for the Infection Preventionists review and follow up.
Was this signal something you wanted to know? You may never know. Real time outbreak detection is possible with WHONET. Let us set it up for you!
Support for WHO-GLASS export
You can find additional information about GLASS below:
- WHO-GLASS Export
- Clinical data
- Laboratory data
- Epidemiological data
GLASS aims to combine clinical, laboratory and epidemiological data on pathogens that pose the greatest threats to health globally. The GLASS manual details the proposed approach for the early implementation of the surveillance system, that will focus on antibiotic-resistant bacteria, and outlines the flexible and incremental development of the system over time that will incorporate lessons learned from the early implementation phase.
Try our support services and let one of our professionals assist you with your setup.
Презентация на тему: " Программное обеспечение микробиологического мониторинга в медицинских организациях. Возможности программы WHONET Саранск, 2014 Саперкин Н.В., к.м.н., доцент." — Транскрипт:
1 Программное обеспечение микробиологического мониторинга в медицинских организациях. Возможности программы WHONET Саранск, 2014 Саперкин Н.В., к.м.н., доцент кафедры эпидемиологии, заведующий организационно-методическим отделом НИИ профилактической медицины НижГМА ГБОУ ВПО НижГМА Минздрава России
2 Распространение программы WHONET в мире
5 Программа WHONET система управления базами данных; предназначена для обработки результатов исследований чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам; используется как в повседневной, так и научной практике. Разработчик: World Health Organization – Всемирная Организация Здравоохранения
7 Аналитические возможности программы Анализ деятельности микробиологической лаборатории: количество исследований, виды исследуемого материала, распределение по отделениям ; Оценка микробиологического мониторинга – в целом, в динамике, по возбудителям, по отделениям ; Оценка антибиотикорезистентности – в динамике, по антибиотикам, по микроорганизмам ; Подбор антимикробных препаратов; Выявление штаммов с одинаковыми профилями резистентности; Контроль качества при лабораторных исследованиях; Изучение эпидемиологии резистентных штаммов.
8 Компоненты WHONET Настройка программы Настройка программы Ввод данных Ввод данных Анализ данных Анализ данных
9 Начальное окно WHONET
10 Основное окно WHONET
11 Настройка лаборатории 6
12 Настройка лаборатории: Антибиотики
13 Наборы (панели) антибиотиков
14 Настройка: Местонахождение больного
16 Создаём новый файл:
18 Экран для ввода данных
19 Способы ввода данных в программу количественные результаты. (например, 13 мм, 64 мг/мл) качественные результаты (R = резистентный, I = промежуточный, S = чувствительный)
24 Анализ данных Создание сводок данных (line listing) % резистентных и чувствительных культур Анализ одновременно по нескольким файлам Графики рассеивания (скаттерграммы) Профили резистентности BacTrack – оценка тревожных сигналов о штамме или группе штаммов
27 Выбор конкретных микроорганизмов для анализа
31 Анализ: Построчный перечень и сводка Ежедневный обзор перечня всех культур специалистами по эпиднадзору. Еженедельный или ежемесячный обзор перечня всех больных с грам-отрицательными микроорганизмами в посеве крови. Еженедельный или ежемесячный обзор перечня всех больных со штаммами, высеянными из суставов и т.п. Еженедельный или ежемесячный обзор перечня всех больных с MRSA, MRSE. Ежемесячная сводка по выделенным организмам может помочь установить вспышку внутрибольничной инфекции. Выводы по локализации и распространению выделенных MRSA могут предположительно указать на проблемную сферу.
32 Пример сводки по культурам: часть 1
33 Пример сводки по культурам: часть 2
36 Пример подсчёта % чувствительных штаммов
37 Соотношение чувствительных и резистентных к антибиотикам штаммов E. coli за определенный период времени
38 Анализ: Профили резистентности
39 Анализ: Г и с т о г р а м м ы
40 Анализ: Графики рассеивания Сравнение двух разных тестов
41 WHONET в практической деятельности
42 Application of WHONET in the Antimicrobial Resistance Surveillance of Uropathogens: A First User Experience from Nepal // Ghosh AN [et al]. – – 7(5). – P Out of the 3209 specimens, 497 bacterial isolates were obtained … Escherichia coli (66.2%) was the commonest bacterial isolate…Among the gram-negative enteric bacilli, a high prevalence of resistance was observed against ampicillin and ciprofloxacin.
44 Application of WHONET for the surveillance of antimicrobial resistance // Sharma A, Grover P.S. – – 22(2). – P antimicrobial sensitivity of 4,289 bacterial isolates…Drug resistance was high in most of the isolates. It was maximum (80-94%) for ampicillin, nalidixic acid and cotrimoxazole.
45 Antimicrobial resistance in gram negative bacteria isolated from intensive care units of Colombian hospitals, WHONET 2003, 2004 and 2005 // [Article in Spanish] Miranda M.C. [et al]. – –26(3). – P The susceptibility tests were performed by automated methods in 9 hospitals…The high resistance rates reported especially for A. baumannii, evidenced the presence of multidrug resistant bacteria in both ICUs and wards at every studied institution.
46 Analysis of antimicrobial drug resistance of Staphylococcus aureus strains by WHONET 5: microbiology laboratory database software // Mochizuki T. [et al]. – – 71(5). – P The data of 2,113 Staphylococcus aureus strains were accumulated and analyzed. Overall Oxacillin resistance ratio in our hospital was 65.7%. The ward of the smallest Oxacillin resistance ratio was Pediatrics/Ophthalmology ward.
47 Monitoring antibiotic resistance in Argentina. The WHONET program, // Rossi A. [et al]. – – 6(4). – P In Argentina the program was developed through a network of 23 public and private hospitals that participate in national and international quality-control programs… the antimicrobial susceptibility of 16,073 consecutive clinical isolates was determined … More than half of the Escherichia coli urinary isolates were resistant to ampicillin and more than 30% to trimethoprim/sulfamethoxazole.
48 In vitro activity of trovafloxacin, of other fluoroquinolones and of related antimicrobials against clinical isolates. Grupo colaborativo WHONET-Argentina // Rossi A. [et al]. – – 59. – Suppl 1. – P The in vitro activity of trovafloxacin…against 5671 clinical isolates recovered by representative institutions of different provinces in our country. The resistance percentage to gentamicin and third generation cephalosporins among enterobacteriaceae was high: 17% and 16% respectively, with a considerable variation according to the analyzed species. The resistance to ciprofloxacin and TRV affected approximately 9% of the isolates….
49 Surveillance of antimicrobial resistance: the WHONET program // Stelling J.M., OBrien T.F. – – 24. – Suppl 1. – P. S Genes expressing resistance to each antimicrobial agent emerged after each agent became widely used. More than a hundred such genes now spread selectively through global networks of populations of bacteria in humans or animals treated with those agents. Information to monitor and manage this spread exists in the susceptibility test results of tens of thousands of laboratories around the world. The comparability of those results is uncertain, however, and their storage in paper files or in computer files with diverse codes and formats has made them inaccessible for analysis..
51 WHONET: removing obstacles to the full use of information about antimicrobial resistance // OBrien T.F., Stelling J.M. – – 25(4). – P WHONET is an information system developed to support The World Health Organizations goal of global surveillance of bacterial resistance to antimicrobial agents..
52 Survey of the levels of antimicrobial resistance in Argentina: WHONET program to 1994 // Rossi M.A. [et al]. – – 6(2). – P Argentina joined WHONET program in Five hospitals from Buenos Aires are taking part…the low level of susceptibility to aminopenicillins, cephalosporins and aminoglycosides is remarkable.
53 WHONET: an information system for monitoring antimicrobial resistance // OBrien T.F., Stelling J.M. – – 1(2). – P. 66.
Презентация на тему: " Микробиологический мониторинг в стационарах Санкт-Петербурга А.К. Хаджидис – Главный клинический фармаколог КЗ СПб Е.Н. Колосовская – Зав. отделом клинической." — Транскрипт:
1 Микробиологический мониторинг в стационарах Санкт-Петербурга А.К. Хаджидис – Главный клинический фармаколог КЗ СПб Е.Н. Колосовская – Зав. отделом клинической эпидемиологии МИАЦа Л.А. Кафтырева – Главный бактериолог КЗ СПб М.Г. Дарьина – зам. Зав.отдела клинической эпидемиологии МИАЦа
2 Антибиотики АБ и вакцины больше, чем что-либо повлияли на жизнь человечества из достижений медицинской науки Проблему антибиотиков изучают микробиологи, химики, биохимики, радиобиологи, клиницисты, клинические фармакологи и др. Одна из самых динамично развивающихся групп препаратов, т.к. существующее явление биологической резистентности микробов необратимо?! Создание нового АБ – сотни миллионов долларов По мнениям мировых экспертов ~ в 75% случаев АБ назначают необоснованно
3 Механизмы (мишени) действия антибактериальных препаратов Пептидные антибиотикиХинолоны Нитрофураны Нитроимидазолы Бета-лактамы Гликопептиды Фосфомицин Изониазид Циклосерин Этамбутол Этионамид Синтез клеточной стенки Синтез белка Репликация ДНК Топо изомераза Транскрипция РНК Биосинтез нуклеотидов Полипептид иРНК Аминогликозиды, Макролиды Тетрациклины, Хлорамфеникол Фузидиевая к-та, Срептограмины Оксазолидиноны Рифамицины Сульфаниламиды Триметоприм Целостность цитоплазматической мембраны
4 Микробиологический мониторинг объединяет усилия Микробиологов Лечащих врачейЭпидемиологов ИК Клинических фармакологов СИСТЕМА ИНФЕКЦИОННОГО КОНТРОЛЯ СИСТЕМА ИНФЕКЦИОННОГО КОНТРОЛЯ
5 Стандарты инфекционного контроля для стационаров Санкт-Петербурга Приказ Комитета по здравоохранению Санкт-Петербурга и Центра Госсанэпиднадзора в Санкт-Петербурге N 86/80 от 10 марта 1998 I. Структура управления системой ИК II. Учет и регистрация госпитальных инфекций III. Микробиологическое обеспечение IV. Эпидемиологическая диагностика ГИ V. Профилактические и противоэпидемические мероприятия в системе ИК VI. Обучение персонала VII. Охрана здоровья персонала
6 Микробиологический мониторинг Изучение эпидемиологических характеристик: Этиологической структуры Резистентности возбудителей: тенденции развития, механизмы Эпидемиологических связей между микроорганизмами: выявление вспышек, эпидемиологически значимых штаммов Гарантия качества тестирования в лаборатории Необходимо создание электронной базы данных
7 Методы определения чувствительности Лабораторные: Диффузионные методы: - диско-диффузионный метод - Е-тест Методы серийных разведений АМП в питательной среде: - разведение препарата в жидкой питательной среде - разведение препарата в плотной питательной среде Другие: Эпидемиологические данные Статистические данные Клинические данные (наиболее вероятные возбудители, взависимости от локализации)
8 Биология антибиотикорезистентности Формирование устойчивости к антибактериальным препаратам – естественное свойство микроорганизмов Полное предотвращение и элиминация устойчивости невозможны Необходима стратегия по сдерживанию формирования устойчивости и «сосуществованию» с устойчивыми микроорганизмами
9 Принципы организации микробиологического мониторинга Определение групп пациентов, подлежащих обследованию: показания, сроки, количество (наличие протокола) Стандартный набор необходимых сведений о пациенте (направление) Качественный забор и доставка материала в лабораторию Использование стандартных, согласованных с лечащими врачами, клиническими фармакологами и госпитальными эпидемиологами наборов антибиотиков для тестирования
10 Распоряжением КЗ «О внедрении микробиологического мониторинга, как элемента инфекционного контроля» 405-Р от Определена необходимость организации: электронной базы данных в каждом стационаре (на основе программы WHONET) общегородской базы данных микробиологического мониторинга регулярного выпуска бюллетеней по результатам анализа данных
11 Распоряжением КЗ «О внедрении микробиологического мониторинга, как элемента инфекционного контроля» 405-Р от Созданы: Электронные базы данных на основе программы WHONET в 79% многопрофильных стационаров 88% детских стационаров родильном доме 18 и 16 (с 2009 г) Городском КВД Психиатрической больнице им.Скворцова-Степанова Общегородская база данных микробиологического мониторинга создана в 2008 году выпуск аналитических материалов начат с 2009 года
12 Создание общегородской электронной базы данных Письмо первого заместителя Председателя КЗ В.Е. Жолобова от / /0700 главным врачам ГУЗ об исполнении Распоряжения КЗ 405-р от г «О внедрении микробиологического мониторинга как элемента инфекционного контроля»
13 штаммах В 2008 году в ОМОКЭ создана городская база данных о чувствительности микроорганизмов в которой объединены базы данных 10 ГУЗ стационарного типа содержит информацию о штаммах «Городская больница 2» «Мариинская больница» «Городская больница 26» «Александровская больница» «Госпиталь ветеранов войн» «Гор.онкологический диспансер» «НИИ СП им. Джанелидзе «Детская больница им. Филатова» «Родильный дом 18» «ГПБ 3 им.Скворцова-Степанова»
14 Структура базы данных 2008 год МикроорганизмВсего штаммов% 1. S. aureus288310,9 2. E.coli24599,3 3. S.epidermidis18617,0 4. S.viridans16306,2 5. Enterococcus spp.16216,1 6. Klebsiella spp.14645,5 7. Candida spp.12634,8 8. Pseudomonas spp.9203,5 9. Enterobacter spp.9283,5 10. Acinetobacter spp.8113,1 Всего 10 ведущих м/о ,9 Всего выделено штаммов
15 «Проблемные» микроорганизмы Метициллинрезистентные стафилококки Устойчивость ко всем бета-лактамам Модификация мишени действия Ванкомицинрезистентные энтерококки Модификация мишени действия Энтеробактерии, устойчивые к цефалоспоринам III поколения Инактивация - продукция бета-лактамаз классов А или С P. aeruginosa Устойчивость к цефалоспоринам - инактивация – продукция бета- лактамаз Устойчивость к карбапенемам – активное выведение или снижение проницаемости Устойчивость к фторхинолонам – модификация мишени действия Пенициллинрезистентный пневмококк Модификация мишени действия -изменение пенициллинсвязывающих белков
16 Организация надзора за индикаторными микроорганизмами Метициллин-резистентный золотистый стафилококк – MRSA Кишечные палочки, продуцирующие БЛРС - E.coli - EBSL+ Клебсиеллы, продуцирующие БЛРС - Klebsiella pneumonia – EBSL+ Синегнойные палочки – Pseudomonas aeruginosa, устойчивые к карбапенемам
17 Организация надзора за индикаторными микроорганизмами Устойчивость штаммов к бета- лактамным антибиотикам, а также ассоциированная устойчивость к препаратам других групп, ведет к неэффективности антибактериальной терапии
18 Выделение индикаторных микроорганизмов из крови 2008 г. 7 стационаров, реанимационные отделения 424 штамма 28 видов микроорганизмов 248 штаммов из числа ведущих возбудителей: S.aureus E.coli K.pneuminiae P.aeruginosa E.faecalis, E.faecium
19 Этиологическая структура высевов из крови 2008 г. 7 стационаров, реанимационные отделения 14 штаммов Candida albicans
25 Решение Коллегии Комитета по здравоохранению от 28 мая 2009 г 4 Разработать и представить на утверждение Стандарт по организации наблюдения за клинически значимыми микроорганизмами в учреждениях здравоохранения
26 Бактериологические лаборатории стационаров и обслуживающие стационары Бактериологические лаборатории, обслуживающие родильные дома Научно-методический центр по молекулярной медицине Координационно-методический СОВЕТ городской отдел клинической эпидемиологии Референс- лаборатория Тестирование MRSA, VRE, штаммов микроорганизмов, выделенных от больных в период вспышек, проблемных микроорганизмов: Klebsiella spp., Pseudomonas spp. и др.
27 Организация референс- лаборатории в Санкт-Петербурге Подготовлено: Обоснование необходимости организации микробиологической референс-лаборатории для мониторинга резистентности к амп и диагностики условно-патогенных микроорганизмов
28 Организация референс- лаборатории в Санкт-Петербурге Разработано: Положение об экспертной (референс) лаборатории по тестированию условно- патогенных микроорганизмов – возбудителей гнойно-септических инфекций на антибиотикорезистентность
29 Микробиологический мониторинг объединяет усилия Микробиологов Лечащих врачейЭпидемиологов ИК Клинических фармакологов СИСТЕМА ИНФЕКЦИОННОГО КОНТРОЛЯ СИСТЕМА ИНФЕКЦИОННОГО КОНТРОЛЯ
Читайте также: